Les débouchés du master sont très variés, par exemple :
- structures de recherche (grands organismes de recherche, agences de recherche, laboratoires de recherche publique, centres de R&D de laboratoires privés ou d’entreprises) ;
- pôles de compétitivité ;
- collectivités publiques (services de l’État, régions, villes, conseils généraux, structures intercommunales) ;
- services internationaux des universités, des villes, des régions, des collectivités publiques ;
- structures déconcentrées de gestion de certains programmes européens ;
- centres d’information et de formation sur les politiques européennes et les programmes européens ;
- cabinets de conseil en innovation et projets européens, ou en financements européens pour les collectivités et les ONG ;
- chambres de commerce et d’industries, organisations professionnelles, syndicats professionnels, comités d’expansion économique ;
- ONG et associations ;
- cabinets de lobbying ;
- représentations de fédérations professionnelles ou de collectivités auprès de l’Union européenne, réseaux européens ;
- institutions européennes (sur concours) ou organisations internationales.